近日，一则来自创新药龙头百济神州的补税公告在跨境圈引起了轩然大波。其境内全资子公司与主管税务部门完成确认，需补缴税款及滞纳金合计约4.46亿元。虽然此次事件并未涉及行政处罚，但真金白银的支出却给企业带来了不小的影响。

2025年全年，百济神州归母净利润为14.61亿元，此次补缴的金额相当于全年净利润的三成，这使得企业的利润大幅蒸发。不过，此次补税并非是企业蓄意逃税所致，而是在开展跨境业务、申领税收优惠的过程中，企业的税务核算与合规口径和税务机关存在分歧。 百济神州所涉及的两项税收优惠政策，是很多高新科技型、制造型出海企业正在享受的政策。一是高新技术企业资质，可将企业所得税税率从25%降至15%；二是研发费用100%加计扣除。这些政策的初衷是为了鼓励企业进行技术创新，但当企业的业务架构走向全球化时，税收优惠的适用边界就变得模糊起来。境内公司享受着国内的税收减免政策，然而研发活动和服务供给却分布在全球各地，对于哪些费用能够享受优惠、哪些不能，企业的判断和执法口径一旦出现偏差，就会埋下补税的隐患。 百济神州的问题具体出在支付的品牌、技术授权费这两项大额成本被剔除。这导致企业应税所得大幅上升，构成了本次补税的第二部分来源。 实际上，百济神州并非个例。据统计，截至2026年6月，今年已有近70家上市公司披露了补税相关信息，累计涉及金额达数十亿元。 有律师分析指出，这一轮补税潮的核心原因在于金税四期的全面落地。金税四期实现了多部门的数据穿透，能够更精准地监管企业的税务情况。同时，税收优惠政策的严格监管以及《增值税法》的实施，也迫使企业对过往甚至十年的历史税务隐患进行集中清算。 对于跨境企业来说，这无疑是一个警示。在享受税收优惠政策的同时，必须更加注重税务合规，准确把握税收政策的适用边界，避免因税务核算与执法口径的差异而带来补税风险。企业应该加强内部税务管理，建立健全税务风险防控机制，及时调整税务策略，以适应不断变化的税收环境。

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